Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkchP23298 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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