Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tap1P21958 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tap1P21958 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms