Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb9P20615 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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