Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PrkcaP20444 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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