Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou5f1P20263 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms