Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VimP20152 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VimP20152 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VimP20152 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VimP20152 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VimP20152 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms