Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnnc1P19123 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms