Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cd5P13379 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms