Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prf1P10820 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prf1P10820 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms