Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PolP10400 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PolP10400 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PolP10400 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PolP10400 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PolP10400 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PolP10400 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PolP10400 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PolP10400 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PolP10400 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms