Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Schip1P0DPB4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Schip1P0DPB4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms