Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01678 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01678 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01678 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01678 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01678 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01678 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01678 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01678 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms