Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01645 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01645 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01645 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01645 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01645 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01645 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01645 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01645 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01645 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01645 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms