Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01644 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01644 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01644 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01644 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01644 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms