Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xirp1O70373 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms