Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lnx1O70263 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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