Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cbx4O55187 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms