Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrxO55103 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrxO55103 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrxO55103 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrxO55103 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms