Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phox2bO35690 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms