Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Lhx8O35652 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhx8O35652 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lhx8O35652 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lhx8O35652 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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