Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RaxO35602 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RaxO35602 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RaxO35602 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RaxO35602 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RaxO35602 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms