Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema6aO35464 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms