Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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Abcc1O35379 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Abcc1O35379 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Abcc1O35379 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Abcc1O35379 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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Abcc1O35379 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Abcc1O35379 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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Abcc1O35379 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc1O35379 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc1O35379 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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