Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nedd9O35177 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd9O35177 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nedd9O35177 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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