Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcns1O35173 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms