Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1aO35134 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1aO35134 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms