Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ArxO35085 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ArxO35085 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ArxO35085 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ArxO35085 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ArxO35085 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ArxO35085 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ArxO35085 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ArxO35085 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ArxO35085 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ArxO35085 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ArxO35085 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms