Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alkal1J3QPP8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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