Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21900J3QP38 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm21900J3QP38 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm21900J3QP38 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm21900J3QP38 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm21900J3QP38 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21900J3QP38 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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