Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm20918J3QN17 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20918J3QN17 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms