Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Top6blJ3QMY9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top6blJ3QMY9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Top6blJ3QMY9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top6blJ3QMY9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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