Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Calhm3J3QMI4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Calhm3J3QMI4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms