Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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