Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sclt1G5E861 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sclt1G5E861 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms