Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r58G3X9U3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms