Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms