Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Crocc2F6XLV1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Crocc2F6XLV1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms