Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5861F6VCN9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms