Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cald1E9QA15 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms