Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7E4

Gm8882, Predicted gene 8882, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8882E9Q7E4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8882E9Q7E4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8882E9Q7E4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms