Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccdc71lE9Q4T4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms