Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm3095E9Q058 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm3095E9Q058 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm3095E9Q058 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm3095E9Q058 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Gm3095E9Q058 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3095E9Q058 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms