Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc8E9PWG2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc8E9PWG2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms