Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Clca3bE9PUL3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clca3bE9PUL3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms