Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc13D3YV10 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc13D3YV10 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms