Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx8D3YU81 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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