Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms