Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam71aB7XG49 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms