Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pnldc1B2RXZ1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms