Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5483B2RV77 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms